En 1929 los Hermanos Maristas se hacen cargo del Instituto Alonso de Ercilla, que había nacido diez años antes de la mano del sacerdote español Don Ángel León y Sanz. Se ubicaba en calle Catedral 2029 (edificación hoy destruida). La primera Comunidad la componían 8 hermanos. En su primer año de vida, el pequeño colegio albergaba 233 alumnos que asistían a un Kindergarten, 3 Preparatorias y 1º y 2º de Humanidades. Las clases comenzaron un 11 de marzo, pero el edificio no ofrecía mucha seguridad, por lo que se buscó uno nuevo. La propiedad elegida fue la esquina de Santo Domingo con Maturana, ubicación actual del colegio.
Durante el año 1934 comenzó la construcción y ya en 1938 se completaron hasta el segundo piso todas las salas de clases que dan a la calle Maturana. Era el primer paso hacia el edificio actual. Las obras las vigiló el Hno. Arturo.
En el año 1953 la Congregación Marista adquiere un terreno entre Las Condes y La Reina, la finalidad de esta adquisición era el futuro Estadio del Colegio. En la actualidad es la propiedad del Centro de Espiritualidad Marista de Santiago. En el año 1955 se realiza la construcción del Hall de Entrada y dependencias, sobre todo el Salón de Honor del tercer piso.
Durante este período el Colegio llegó a contar con 28 profesores y 876 alumnos. De los profesores, 23 eran Hermanos y sólo 5 seglares, entre ellos los Sres. Santiago Krogh (5ª Preparatoria), Alberto Veloz (Educación Cívica) y Abel Enríquez (Artes Plásticas), todos con larga tradición en el Ercilla. El año 1963 se produce el boom de las nuevas construcciones es así como van surgiendo el Pabellón de Media (actualmente salas de 7° y 8°), el sector norte de la gran Casa de los Hermanos (piezas, cocina, comedor, recibidores) y el gran comedor para los mediopupilos (actual Biblioteca Hno. Fernando de la Fuente). El año 1964 se pudo inaugurar la gran Capilla Central, con su decoración externa de "muri-glass" y su gran mural de los "Tres Primeros Puestos", pintado por Claudio Di Girólamo.
El año 1967 se compra la casa de Don Hilario y comienza la construcción de la nueva Sección Infantil (en Baquedano con Rosas). Esta sección seguía a cargo de las Madres Josefinas Trinitarias, que dejarán el colegio a fines de 1984.